Unigene RO454_v2 SSRs with in silico polymorphism

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The SSR finding software has flagged some sequences with a * because they have some evidence that they are "polymorphic" based on the underlying alignments of the contigs. The software looks for one of four characteristics: a 2bp or larger gap in consensus sequence in SSR region, multiple 1bp gaps in consensus sequence in SSR region, a gap at either end of consensus with another repeat of the motif at corresponding region of an underlying sequence, a gap of 2bp or more in an underlying sequence. Additionally, these sequences have enough flaking sequence to have primers that amplify the SSR region.
RO454_contig10237_v2_180
RO454_contig10332_v2_233
RO454_contig1040_v2_60
RO454_contig1044_v2_241
RO454_contig10532_v2_25
RO454_contig10718_v2_255
RO454_contig11183_v2_232
RO454_contig11266_v2_309
RO454_contig11702_v2_187
RO454_contig11824_v2_351
RO454_contig12361_v2_102
RO454_contig12362_v2_226
RO454_contig12660_v2_128
RO454_contig12791_v2_28
RO454_contig12927_v2_91
RO454_contig12952_v2_204
RO454_contig13173_v2_1800
RO454_contig13552_v2_253
RO454_contig14000_v2_74
RO454_contig15439_v2_115
RO454_contig15631_v2_121
RO454_contig15716_v2_821
RO454_contig16270_v2_353
RO454_contig17748_v2_154
RO454_contig18183_v2_156
RO454_contig21146_v2_812
RO454_contig21423_v2_217
RO454_contig2216_v2_170
RO454_contig2233_v2_317
RO454_contig22499_v2_199
RO454_contig2320_v2_177
RO454_contig2410_v2_331
RO454_contig25117_v2_259
RO454_contig25233_v2_204
RO454_contig25426_v2_1069
RO454_contig25623_v2_186
RO454_contig257_v2_172
RO454_contig26333_v2_70
RO454_contig26333_v2_172
RO454_contig26783_v2_200
RO454_contig26859_v2_217
RO454_contig27165_v2_96
RO454_contig27210_v2_130
RO454_contig3172_v2_182
RO454_contig3787_v2_200
RO454_contig4391_v2_438
RO454_contig4788_v2_230
RO454_contig4902_v2_121
RO454_contig5116_v2_214
RO454_contig5732_v2_214
RO454_contig6377_v2_519
RO454_contig6613_v2_230
RO454_contig6712_v2_172
RO454_contig8288_v2_288
RO454_contig915_v2_82
RO454_contig931_v2_152

All Other SSRs

RO454_contig10000_v2_27
RO454_contig10000_v2_7
RO454_contig10010_v2_287
RO454_contig10013_v2_2
RO454_contig10061_v2_60
RO454_contig10063_v2_278
RO454_contig10071_v2_875
RO454_contig10073_v2_458
RO454_contig10073_v2_409
RO454_contig10074_v2_634
RO454_contig10074_v2_622
RO454_contig10084_v2_224
RO454_contig10084_v2_236
RO454_contig10084_v2_152
RO454_contig10098_v2_238
RO454_contig100_v2_200
RO454_contig100_v2_369
RO454_contig10127_v2_734
RO454_contig10128_v2_339
RO454_contig10131_v2_2008
RO454_contig10131_v2_2060
RO454_contig10132_v2_91
RO454_contig10132_v2_232
RO454_contig10132_v2_270
RO454_contig10133_v2_173
RO454_contig10137_v2_132
RO454_contig10141_v2_973
RO454_contig10143_v2_312
RO454_contig10143_v2_358
RO454_contig10144_v2_257
RO454_contig10149_v2_306
RO454_contig10150_v2_94
RO454_contig10157_v2_903
RO454_contig10169_v2_291
RO454_contig10172_v2_1
RO454_contig10186_v2_28
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RO454_contig1018_v2_1368
RO454_contig10194_v2_232
RO454_contig10219_v2_273
RO454_contig10220_v2_499
RO454_contig10220_v2_415
RO454_contig10229_v2_216
RO454_contig10231_v2_216
RO454_contig10235_v2_312
RO454_contig10243_v2_2392
RO454_contig10246_v2_10
RO454_contig10247_v2_117
RO454_contig10248_v2_274
RO454_contig1024_v2_71
RO454_contig10269_v2_50
RO454_contig1027_v2_66
RO454_contig1027_v2_53
RO454_contig1027_v2_69
RO454_contig10280_v2_1
RO454_contig10284_v2_3
RO454_contig10286_v2_241
RO454_contig10292_v2_262
RO454_contig10292_v2_15
RO454_contig10297_v2_911
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RO454_contig10298_v2_1
RO454_contig10299_v2_382
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RO454_contig10314_v2_209
RO454_contig10321_v2_86
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RO454_contig10321_v2_703
RO454_contig10323_v2_14
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RO454_contig10443_v2_45
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RO454_contig11035_v2_1
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RO454_contig11206_v2_131
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RO454_contig11229_v2_242
RO454_contig11231_v2_197
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RO454_contig11323_v2_32
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RO454_contig1137_v2_165
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RO454_contig1138_v2_78
RO454_contig11396_v2_324
RO454_contig11397_v2_209
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